در بازی Star Trek Prodigy Supernova باید نقش دال رئل و گویندالا را بازی کنید. می‌توانید خدمه پراکنده آن‌ها را نجات داده و در این ماجراجویی اکشن، به‌صورت تکی یا همراه با یک دوست جلو بروید و ماموریت‌های خود را به اتمام رسانید. پس از اینکه کاراکتی به نام Protostar یک سری قطعات عجیب را از یک ستاره در حال مرگ می‌گیرد، دال رئل و گویندالا با زمان مسابقه داده و به این واسطه دوستان خود را از سفینه‌های بیگانه و کل سیستم سیاره‌ای نجات می‌دهند. جهان بیگانه وارد بازی شده‌اند و مجموعا به سه مورد از این جهان‌ها خواهید رفت تا آن‌ها را کاوش کنید.

با محیط‌های خطرناک آشنا شده و هر کدام هم معماها و چالش‌هایی برای شما خواهند داشت. باید رازهای آن‌ها را کشف کرده و ببینید که دوستان شما در کجا حضور دارند. هنگامی که پروتوستار خدمه را در سه سیاره بیگانه پراکنده می‌کند، دال و گوین باید از هوش و مهارت خود برای غلبه بر پازل‌های متفکرانه استفاده کنند. می‌توانید نبرد با ارتشی از ربات‌های مرگبار را تجربه کرده و در نهایت موفق به نجات جانکوم پوگ، راک تاک، زیرو و مورف شوید. آن‌ها به دنبال دوستان خود می گردند و البته به زودی هم یک دشمن شوم و مرگبار جدید کشف خواهد شد. این دشمن می‌تواند مسیر تاریخ را تغییر داده و می‌دانیم که او در هیچ کاری متوقف نخواهد شد.